In Mobius Klein geht es primär darum, wie sich Fuyuka und Gigelf kennenlernten. Außerdem werden im Manga Charaktere vorgestellt, die später auch in Silent Mobius erscheinen, darunter zählen zum Beispiel Rally Cheyenne und Ganossa Maximillian, ebenso Verwandte anderer Charaktere wie Yamigumo Razan, Namis Großvater.